Тест‑системы для исследования состава микробиоты толстого кишечника

ПЦР‑тесты для исследования микробиоты толстого кишечника позволяют быстро и точно выявлять изменения в составе микроорганизмов, что играет ключевую роль в диагностике острых и хронических заболеваний, метаболических нарушений и раннем выявлении факторов риска.

Микробиоценоз кишечника в норме и патологии

В кишечнике взрослого человека насчитывается около 1014 различных микроорганизмов (бактерии, грибы, вирусы, простейшие). По данным современных молекулярных методов исследования (высокопроизводительное секвенирование, масс-спектрометрия) в формировании разнообразия микробного состава участвуют до 600 родов бактерий.

В норме микробиота толстого кишечника выполняет ряд важных функций:

  • расщепление углеводов и производство короткоцепочечных жирных кислот (КЖК),
  • синтез витаминов (витамин K, витамин B12, фолиевая кислота),
  • синтез аминокислот,
  • участие в регулировании жирового и углеводного обмена (синтез желчных кислот, поддержание нормального уровня резистентности к глюкозе),
  • регуляция локального и системного иммунного ответа.  

На состояние микробиоты толстого кишечника могут оказывать влияние: наличие патологии, рацион питания, прием антибиотиков, пробиотических и пребиотических препаратов, влияние факторов окружающей среды, стресс, особенности образа жизни и т.д. Поскольку около 70 % всех населяющих кишечник бактерий являются сложно-культивируемыми или не культивируемыми, обнаружение их бактериологическими методами не всегда возможно. Молекулярные методы (в частности, метод ПЦР) позволяют решить эту задачу, а также:  

  • позволяют существенно ускорить диагностику острых и хронических заболеваний толстого кишечника,
  • облегчают выявление некоторых патологических состояний толстого кишечника на ранних стадиях, с целью их профилактики.  

Наиболее значимыми для здоровья человека изменениями микробиоценоза кишечника являются изменения, возникающие при:

  • острых инфекциях;
  • хронических заболеваниях и состояниях, таких как: воспалительные заболевания кишечника, или ВЗК (болезнь Крона, неспецифический язвенный колит), синдром раздраженного кишечника (СРК), метаболические нарушения (ожирение, диабет 2-ого типа).

В отдельных случаях изменения состава кишечной микробиоты могут сигнализировать о повышенном риске развития колоректального рака (к таким изменениям относится, в частности, присутствие в фекальных образцах Fusobacterium nucleatum и Parvimonas micra в высоких титрах).

Более подробное описание тест-системы, а также расшифровку результатов исследований можно найти в брошюре "Колонофлор".

  1. Брошюра "Колонофлор"

Статьи и публикации

Исследования, в которых использовался набор реагентов «Колонофлор»

  • Периоперационные изменения микрофлоры толстой кишки у больных колоректальным раком

    С.Ф. Багненко, А.А. Захаренко, А.Н. Суворов, И.В. Шлык, О.А. Тен, Ш.Р.Джамилов, М.А. Беляев, А.А. Трушин, А.С. Натха, Д.А. Зайцев, К.Н. Вовин, В.А. Рыбальченко, Д.О. Акуличев. Биомедицинский журнал Medline.ru, Том 16, онкология, 2015, с. 1302-1316

  • При рассеянном склерозе изменяется качественный и количественный состав микробиоты кишечника

    И. Н. Абдурасулова, Е. А. Тарасова, Е. И. Ермоленко, А. В. Елисеев, А. В. Мацулевич, Г. Н. Бисага, Д. И. Скулябин, А. Н. Суворов, В. М. Клименко. Медицинский академический журнал, 2015 г., том 15, № 3, с.55-68

  • Влияние пробиотиков на продукцию цитoкинов в системах in vitro и in vivo

    Аверина О.В., Ермоленко Е.И., Ратушный А.Ю., Тарасова Е.А., Борщев Ю.Ю., Леонтьева Г.Ф., Крамская Т.А., Котылева М.П., Даниленко В.Н., Суворов А.Н. Медицинская иммунология. 2015;17(5):443-454.

  • Коррекция дисбиоза кишечника крыс индигенными рекомбинантными штаммами энтерококков и длительность их персистирования в составе кишечного микробиоценоза

    Ермоленко Е. И., Свиридо Д. А., Котылева М. П., Карасева А. Б., Ермоленко К. Д., Соловьева О. И. , Симаненков В. И., Суворов А.Н. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология, выпуск 136, № 12 2016, с. 65-69

  • Исследование микробиоты кишечника жителей Вьетнама и России

    Ермоленко Е.И., Котылева М.П., Буй Тхи Лан Ань, Чан Тхи Ньай, Буй Тхи Тхань Нга, Краева Л.А., Гончаров А.Е., Карасева А.Б., Киреева А.Г., Тан Нам, Суворов А.Н. Наука и технологии в тропиках. 2016. 9(9), с. 1979-1990

  • Влияние индигенных энтерококков на микробиоту. Особенности двигательной функции толстой кишки при экспериментальном дисбиозе.

    Е.И. Ермоленко, Н.П. Ерофеев Л.Б. Захарова, Е.Н. Парийская, М.П. Котылева. Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Здоровье – основа человеческого потенциала: проблемы и пути их решения». Том 11, часть 2, 2016 г, с. 769-781. (РИНЦ)

  • Факторы риска заражения Blastocystis spp

    Домбровская Д.А. ФГБОУ ВО «Северо-западный ГМУ им. И.М. Мечникова» МЗ РФ, материалы диссертации, 2016г.

  • Влияние индигенных энтерококков на микробиоту кишечника и поведение крыс при коррекции экспериментального дисбиоза

    Ермоленко Е.И., Абдурасулова И.Н., Котылева М.П., Свиридо Д.А., Мацулевич А.В., Карасева А.Б., Тарасова Е.А, Сизов В.В., Суворов А.Н. Российский физиологический журнал им. И.М. Сеченова, т. 103, №1, 2017, с. 22-37

  • Первый опыт терапии полирезистентных инфекционных осложнений, ассоциированных с Clostridium difficile и Klebsiella pneumoniae, методом трансплантации фекальной микробиоты у пациентов после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток

    О.В. Голощапов, М.А. Кучер, М.А. Суворова, Р.В. Клементьева, А.А. Щербаков, А.Н. Швецов, И.С. Моисеев, А.Б. Чухловин, Б.В. Афанасьев. Инфекционные болезни, 2017, т. 15, №3, с. 65–74

  • Микробиота кишечника при язвенном колите и целиакии

    Ситкин С. И., Вахитов Т. Я., Ткаченко Е. И., Орешко Л. С., Жигалова Т. Н., Радченко В. Г., Селиверстов П. В., Авалуева Е. Б., Суворова М. А., Комличенко Э.В. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология, выпуск 137, № 1 2017, с. 8-30

  • Предикторы формирования функциональных расстройств желудочно-кишечного тракта после норовирусной инфекции у детей

    Ермоленко К.Д., Гончар Н.В., Лобзин Ю.В., Григорьев С.Г. Журнал инфектологии. 2017; 9(2):42-47

  • Effects of Probiotic Enterococci and Glatiramer Acetate on the Severity of Experimental Allergic Encephalomyelitis in Rats

    Abdurasulova, I.N., Ermolenko, E.I., Matsulevich, A.V. et al. Neurosci Behav Physi 47, 866–876 (2017)

  • Saccharomyces boulardii модулируют состав микробиоты кишечника у пациентов с неалкогольной жировой болезнью печени, препятствуя прогрессированию заболевания

    Селиверстов П. В., Ситкин С. И., Радченко В. Г., Лазебник Л. Б., Авалуева Е. Б., Вахитов Т. Я., Демьянова Е. В., Скворцова Т. Э., Приходько Е. М., Суворова М. А. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология 2018, 150(2):4–18

  • Микробиом, дисбиоз толстой кишки и воспалительные заболевания кишечника: когда функция важнее таксономии

    Ситкин С.И., Вахитов Т.Я., Демьянова Е.В. Альманах клинической медицины: 2018; 46(5):396-425

  • Анаэробный дисбаланс микробиоты кишечника у детей разного возраста с вирусной диареей

    Ермоленко Е.И., Гончар Н.В. Гастроэнтерология Санкт-Петербурга, 2018, №2, с.64-64b

  • Эффективность трансплантации фекальной микробиоты у пациентов после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток

    О.В. Голощапов, М.А. Кучер, И.С. Моисеев, А.Н. Швецов, Р.В. Клементьева, А.А. Щербаков, М.А. Суворова, О.В. Станевич, Е.А. Бакин, Л.С. Зубаровская, Б.В. Афанасьев. V Международная конференция «Постгеном», 2018

  • Fecal Microbiota Transplantation as a Novel Method of Multidrug-Resistant Infections Treatment in Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation Recipients

    Maxim Kucher, Oleg Goloshchapov, Maria Suvorova, Ruslana Klementeva, Aleksandr Shcherbakov, Alexandr Shvetcov, Ilya Kazantsev, Ivan Moiseev, Ludmila Zubarovskaya, Boris Afanasyev. Transplantation Research Journal, 2018, Volume 3, Issue 1, 1-3

  • Апробация нового способа подготовки образцов для детекции популяций кишечной микробиоты методом полимеразной цепной реакции

    Маркова Ю.М., Полянина А.С., Минаева Л.П., Шевелева С.А. XVII Всероссийский конгресс диетологов и нутрициологов, 2018, том 87, № 5, с.34-35

  • Изучение микробиоты кишечника у здоровых людей методом ПЦР

    Маркова Ю.М., Полянина А.С., Стеценко В.В. Основы здорового питания и пути профилактики алиментарно-зависимых заболеваний, сборник материалов II школы молодых ученых, 2019, с. 61-63

  • Норма потребления и физиологическая потребность

    Лысиков Ю.А. XVII Всероссийский конгресс диетологов и нутрициологов, 2018, том 87, №5, с.33-34

  • Состав микробиоты кишечника и популяций циркулирующих Th-клеток у пациентов с рассеянным склерозом

    И.Н. Абдурасулова, Е.А. Тарасова, И.В. Кудрявцев, И.Г. Негореева, А.Г. Ильвес, М.К. Серебрякова, Е.И. Ермоленко, Е.В. Ивашкова, А.В. Мацулевич, А.Е. Татаринов, И.Д. Столяров, В.М. Клименко, А.Н. Суворов. Инфекция и иммунитет 2019, Т.9, №3–4, с.504–522

  • Influence of different probiotics on the intestinal microbiota of rats with experimental Clostridium difficile infection

    E. Ermolenko, E. Tarasova, M. Kotyleva, Y. Borschev, A. Suvorov. ECCMID 2014 (Basic Science: Animal models including experimental treatment)

  • Современные методы ДНК-диагностики микрофлоры и ее значение в клинике

    Клементьева Р.В., Щербаков А.А., Швецов А.Н., Кучер М.А., Голощапов О.В. VI Международная конференция, посвященная Дню ДНК, 2019, с.26-27

  • Трансплантация фекальной микробиоты при критическом состоянии пациентов в онкогематологической практике

    О. В. Голощапов, Д. В. Чуракина, М. А. Кучер, Р. В. Клементьева, С. В. Сидоренко, В. В. Гостев, В. Е. Карев, М. А. Суворова, И. В. Шлык, А. Б. Чухловин, Л. С. Зубаровская, Б. В. Афанасьев. Вестник анестезиологии и реаниматологии, 2019, Т.16, №3, с.63-73

  • Long-term impact of fecal transplantation in healthy volunteers

    O.V. Goloshchapov, E.I. Olekhnovich, S.V. Sidorenko, I.S. Moiseev, M.A. Ucher, D.E. Fedorov, A.V. Pavlenko, A.I. Manolov, V.V. Gostev, V.A. Veselovsky, K.M. Klimina, E.S. Kostryukova, E.A. Bakin, A.N. Shvetcov, E.D. Gumbatova, R.V. Klementeva, A.A Shcherbakov, M.V Gorchakova, J.J. Egozcue, V. Pawlowsky-Glahn, M.A. Suvorova, A.B. Chukhlovin, V.M Govorun, E.N Ilina, B.V. Afanasyev. BMC Microbiol. 2019 Dec 30;19(1):312

  • Возможности терапевтического лечения больных желчнокаменной болезнью

    Селиверстов П.В., Скворцова Т.Э., Ситкин С.И., Радченко В.Г. Медицинский совет, №14, 2019, с.44-51

  • Клинико-экспериментальное обоснование коррекции дисбиоза кишечника у больных вирусными циррозами печени

    Саулевич А.В. Материалы диссертации, Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова МО РФ, 2019

  • Akkermansia muciniphila – «новый» представитель микробиоты кишечника: распространенность и диагностическая значимость

    Тарасова Е.А., Баимова Р.Р., Абдурасулова И.Н., Кудрявцев И.В., Суворова М.А. V Российский конгресс лабораторной медицины, 2019, с.251-252

  • Изменения микробиома кишечника при рассеянном склерозе связаны с иммунными психоэмоциональными нарушениями

    Абдурасулова И.Н., Мацулевич А.В., Тарасова Е.А., Кудрявцев И.В., Никифорова И.Г., Серебрякова М.К., Мирошниченко М.И., Ивашкова Е.В., Татаринов А.Е., Ильвес А.Г., Ермоленко Е.И., Бисага Г.Н., Столяров И.Д., Клименко В.М. Медицинский академический журнал, 2019, т.19, №S, с.51-54

  • Перспективы микробиота-ориентированной терапии в нейрореабилитологии

    Белобородова Н.В., Черневская Е.А. Физическая и реабилитационная медицина, медицинская реабилитация, Том 2, №1, 2020

  • Особенность микробиоты толстой кишки у пациентов с разными фенотипами ожирения (пилотное исследование)

    Волкова Н.И., Набока Ю.Л., Ганенко Л.А., Оксенюк О.С. Медицинский вестник Юга России. 2020;11(2):38-45

  • Получение эмульгированного пробиотического препарата Bacillus subtilis и его воздействие на микрофлору кишечника лабораторных крыс

    Скворцов Е.В., Мухаммадиев Р.С., Валлиулин Л.Р., Валлиулина Д.А. Ученые записки Казанской государственной академии ветеринарной медицины им. Н.Э. Баумана, 2020, т.241, №1, с.187-192

  • Микробиота желчного пузыря у пациентов с желчнокаменной болезнью

    Симаненков В.И., Суворов А.Н., Тихонов С.В. и др. Вестник СЗГМУ им. И.И. Мечникова, 2020, т.12, №1, с.37-44

  • Modeling of systemic inflammatory response syndrome by chemical induction of colon injury in rats

    Borschev Y.Y., Burovenko I.Y., Karaseva A.B., Minasyan S.M., Borschev V.Y., Semenova N.Y., Borshcheva O.V., Polovinkin V.V., Rodionov G.G., Suvorov A.N., Galagudza M.M. Medical Immunology (Russia), 2020;22(1):87-98

  • Трансплантация фекальной микробиоты при реакции «трансплантат против хозяина» у детей и взрослых: методы, клинические эффекты, безопасность

    Голощапов О.В., Чухловин А.Б., Бакин Е.А., Станевич О.В., Клементьева Р.В., Щербаков А.А., Швецов А.Н., Суворова М.А., Бондаренко С.Н., Кучер М.А., Кулагин А.Д., Зубаровская Л.С., Моисеев И.С. Терапевтический архив, 2020, Т.92, №7, с.43-54

  • Таксономический дисбиоз микробиоты и сывороточные биомаркеры как отражение тяжести поражения центральной нервной системы

    Черневская Е.А., Меглей А.Ю., Буякова И.В., Ковалева Н.Ю., Горшков К.М., Захарченко В.Е. и др. Вестник РГМУ. 2020; (5): –. DOI: 10.24075/vrgmu.2020.05

  • Влияние микробиоты кишечника на биохимические показатели у больных с метаболическим синдромом

    Котрова А.Д, Котылева М.П., Сарайкина Д.А. Материалы научной конференции «Фундаментальная наука и клиническая медицина – человек и его здоровье». Санкт-Петербург, 26 сентября 2020 г.

  • Микробиом кишечника и его роль в развитии инфекций кровеносного русла у больных гемобластозами

    Кулешова А.В., Киселева Е.Е., Чеботкевич В.Н. Журнал «Гастроэнтерология Санкт-Петербурга», № 1–2, 2020 г.

  • Применение пробиотического штамма Enterococcus faecium L 3 при гастроэнтерите у поросят

    А.Л. Сепп, А.В. Яшин, В.Д. Раднатаров. Ветеринария и зоотехния, № 3 (60), 2020 г., стр. 74–80

  • Применение бициклола в терапии тяжелого фиброза печени: экспериментальное обоснование

    Жданов К.В., Саулевич А.В., Козлов К.В., Захаренко С.М., Сукачев В.С., Карев В.Е., Захаркив Ю.Ф., Потехин И.В., Мухтаров Р.М., Касьяненко К.В., Карякин С.С., Черненок М.Г. Журнал инфектологии. 2020;12(5):93–100.

  • Механизмы формирования постинфекционной г патологии у детей – реконвалесцентов ротавирусной инфекции

    Ермоленко К.Д., Гончар Н.В., Лобзин Ю.В. Журнал инфектологии. 2020;12(5):56–61.

  • Характеристика кишечного дисбиоза у больных неалкогольной жировой болезнью печени

    G. D. Fadieienko, A. Y. Gridnyev, I. E. Kushnir, O. G. Kurinna, V. M. Chernova, T. A. Solomentseva, Ya. V. Nikiforova, V. Yu. Galchinska, T. M. Bondar. Украинский научно-практический специализированный журнал «Современная гастроэнтерология», № 6 (2020), 2020-1505

  • Проблемы организации профилактической работы в амбулаторных условиях с детьми дошкольного возраста

    Кравченко И.А., Баймурадова Э.А., Полунин В.С. Журнал «Кардиоваскулярная терапия и профилактика», Том 20, № S1, 2021, стр. 46

  • Медико-социальные особенности когнитивных нарушений у пациентов, перенесших транзиторную ишемическую атаку

    Кравченко В.Г., Костенко Е.В., Горшков Д.В. Журнал «Кардиоваскулярная терапия и профилактика», Том 20, № S1, 2021, стр. 45

  • Микрофлора кишечника крыс при экспериментальном антибиотикоассоциированном дисбиозе и возможность ее коррекции препаратом на основе молочнокислых и пропионовокислых микроорганизмов

    Мухаммадиева А.С., Мухаммадиев Риш.С., Усольцев К.В., Мухаммадиев Рин.С., Скворцов Е.В., Валлиулин Л.Р. Ученые записки Казанской государственной Академии ветеринарной медицины им. Н.Э. Баумана, Том 246, № 2, 2021, стр. 141–145

  • Влияние препарата «Хилак Форте» на восстановление слизистой оболочки толстой у больных с пищевой токсикоинфекцией и сопутствующимдисбиозом кишечника

    Леонтьева Н.И., Щербаков И.Т., Грачева Н.М., Соловьева А.И., Лиханская Е.И. Журнал «Гастроэнтерология Санкт-Петербурга», № 1–2, 2021, стр. 24

  • Гендерная оценка микробиома кишечника у больных с ожирением

    А. Д. Котрова, А. Н. Шишкин, Л. С. Воропаева, Н. С. Лавренова, Л. А. Слепых, М. В. Лукашенко, Е. И. Ермоленко. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология, № 10 (2021): 91–99

  • Линкомецин-ассоциированный дисбиоз кишечника крыс

    Скворцов Е. В., Усольцев К. В., Мухаммадиев Риш. С., Мусин Р. Р., Быкова П.Р. Журнал «Ветеринарный врач», 2021, Казань

  • Гомеостаз кроликов при сочетанном металлотоксикозе

    Потапова С.Н., Сагдеев Д.Р., Кадиков И.Р., Корчемкин А.А., Вафин И.Ф. Журнал «Ветеринарный врач», 2021, Казань

  • Индукция фиброза печени у лабораторных крыс WISTAR

    Жданов К. В., Саулевич А. В., Козлов К. В., Захаренко С. М., Сукачев В. С., Мухтаров Р. М., Касьяненко К. В. Известия Российской Военно-медицинской академии, 2021, 40(S1), 26–29.

  • Особенности состава микробиоты кишечника у больных артериальной гипертензией с абдоминальным ожирением

    Коваль С.М., Снигурская И.О., Юшко К.О., Мисниченко О.В., Гальчинская В.Ю. Журнал «Патология», ГУ «Национальный институт терапии имени Л. Т. Малой НАМН Украины», г. Харьков, Украина, Том 18, № 3 (2021)

  • Анализ частых мутаций и варианты течения хронического панкреатита у

    Минина С., Корниенко Е., Суспицын Е., Имянитов Е. «Гастроэнтерология Санкт-Петербурга». Учредители: ООО «Гастро», Ситкин Станислав Игоревич, стр. 24–25

  • Изменения состава кишечной микробиоты при моделировании системного воспалительного ответа у крыс разного возраста

    Карасёва А. Б., Буровенко И. Ю., Цапиева А. Н., Борщев Ю. Ю., Суворов А. Н., Галагудза М. М. Университетский терапевтический вестник, 2022, 4(2), 42–51

  • Персонифицированная симбионтная терапия детей с затяжным течением кампилобактериоза

    Ермоленко К. Д., Гончар Н. В., Ермоленко Е. И. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология, 2022, (1), 31–33